Model: CodonCode Aligner
Hãng sản xuất: CodonCode Corporation -Mỹ
Giá bán: 14,600USD
A. Sequence Comparison & Alignment
• Hỗ trợ pairwise alignment (so sánh 2 trình tự) và multiple sequence alignment (nhiều trình tự).
• Tự động căn chỉnh trình tự trước khi phân tích sâu.
• Giao diện trực quan để xem các khác biệt điểm vị trí (mismatch), SNP và các biến thể khác.
B. Assembly / De Novo & Reference Assembly
• Lắp ghép trình tự từ các đoạn ngắn (reads) thành contigs.
• Hỗ trợ reference assembly (lắp ghép theo trình tự mẫu chuẩn).
• Hỗ trợ nhiều định dạng tệp input: FASTA, FASTQ, ABI, SCF…
C. Variant Detection & Annotation
• Phát hiện SNP, indel, frameshifts tự động.
• Giao diện đánh dấu biến thể rõ ràng trong alignment.
• Xuất báo cáo biến thể dạng bảng và định dạng chuẩn cho downstream analysis.
D. Reporting & Export
• Xuất alignment, trích đoạn biến dị thành định dạng PDF, Excel, TXT, FASTA.
• Tạo report chuyên nghiệp cho publication hoặc báo cáo dự án.
E. Hệ điều hành hỗ trợ
Hỗ trợ Hệ điều hành Windows
F. Định dạng dữ liệu vào/ra
Định dạng Input:
• FASTA / FASTQ
• ABI / AB1 / SCF (chromatogram)
• Custom text sequences
Định dạng Output:
• PDF / TXT / FASTA / Excel
• Alignment graphics / SNP tables & reports
Đánh giá
Chưa có đánh giá nào.